小儿肛门检查的方法有视诊、触诊、肛门镜检查、直肠镜检查、肛门B超检查等。具体的检查方法还需要带小儿到当地正规医院就诊，由医生结合其临床症状进行判断。
1、视诊：此方法可以直接观察到小儿肛门周围的皮肤是否存在溃烂、红肿等。
2、触诊：在检查前医生需要佩戴手套，然后在小孩肛门周围涂抹润滑油，将手指缓缓地插入肛门内，可以了解是否存在肛瘘、肿块等。
3、肛门镜检查：属于一种常规的检查，在检查过程中需要将一个带摄像头的管子深入到肛门内，有利于了解肛门内部的情况。
4、直肠镜检查：此方法需要将一条柔软的管子，通过肛门放置于直肠内，通过内部的摄像头可以了解直肠内部以及肛门周围是否存在病变，例如肛裂、肛门息肉等。
5、肛门B超检查：此方法需要将仪器的探头放置在肛门部位进行扫描，通过影像显示可以了解肛门部位是否存在病变。
在检查前尽量排空肠道内的内容物，有利于观察肛门内部的情况。在检查前应安抚小儿的情绪，使其保持放松。