核磁共振后手关节疼痛可能是操作不当、造影剂刺激、肌肉劳损、外伤、骨关节炎等原因导致。如果手关节疼痛伴有肿胀、活动受限等情况，建议及时到医院就诊，明确诊断，配合医生进行治疗。
1、操作不当：核磁共振检查时，如果医生手法不正确或姿势不对，对患者手臂造成压迫和刺激，可能会引起手关节疼痛。
2、造影剂刺激：手关节处做核磁共振时需要注入造影剂，可能会引起局部血管扩张，导致核磁共振后手关节处有疼痛感。
3、肌肉劳损：患者长时间从事重体力劳动或进行剧烈运动，容易引起手关节处肌肉劳损，做核磁共振时，肌肉劳损还没有完全恢复，可能会有酸胀、疼痛等现象。
4、外伤：核磁共振检查过程中，如果患者的手关节被过度挤压或扭伤，可能会导致局部软组织受损，伴有疼痛感。
5、骨关节炎：骨关节炎会引起关节肿大、关节间隙变窄，导致手部疼痛。核磁共振检查时会对局部产生一定刺激，加重疼痛感。
建议患者保持放松，积极配合医生完善检查，必要时根据医生指示进行治疗，减少身体的不适感。此外，还要注意安全，避免关节损伤。