磷酸苯丙派林属于一种镇咳药，常见的剂型为片剂，阿莫西林属于一种广谱青霉素类抗生素药物，常见的剂型有片剂、胶囊、颗粒等，两种药物相比较可能磷酸苯丙哌林更好，也可能阿莫西林更好，需要根据用药目的进行分析。当患者对用药方案存在疑问时，可前往医院咨询专业医生，让专业医生站在医学角度上进行详细讲解。
如果患者使用药物的目的是为了缓解急性支气管炎或者慢性支气管炎引起的咳嗽，一般使用磷酸苯丙哌林比较好，因为该药物能够直接作用于镇咳中枢，具有较好的止咳作用。
但如果使用药物的目的是为了治疗敏感菌感染所引起的泌尿系统疾病、呼吸系统疾病等，比如尿路感染、肺炎、上呼吸道感染等，通常选择阿莫西林比较好，因为阿莫西林具有抑制细菌合成和杀灭细菌的功效。
无论使用哪种药物，在用药时都应保持正确的用药方法，不要自行盲目增减药量，同时在用药期间减少酒精、咖啡等刺激性饮品的摄入，以免影响药效正常发挥。