13岁男孩脸上长痘痘可能是由于毛囊炎、湿疹、痤疮、接触性皮炎、皮癣等原因引起的，建议及时到医院完善相关检查，在医生的指导下规范用药。
1、毛囊炎：一般是细菌感染引起的，脸上可能会出现一些以毛囊为中心的红色丘疹，表现为痘痘症状。可以在医生的指导下使用红霉素软膏、莫匹罗星软膏等药物进行治疗，能够起到抗炎的作用。
2、湿疹：通常是由遗传或食物过敏等引起的，会导致皮肤上长红色丘疹或丘疱疹，引起瘙痒或肿胀。可遵医嘱使用氯雷他定片、盐酸左西替利嗪口服溶液等药物进行治疗，能够起到抗过敏的作用。
3、痤疮：通常是由痤疮丙酸杆菌感染或者皮肤油脂分泌旺盛所致，脸上会长粉刺样痘痘，还可能伴有皮肤毛孔粗大。需要在医生的指导下使用维A酸乳膏、水杨酸软膏等药物进行治疗，能够促进痤疮消退。
4、接触性皮炎：一般是使用劣质的护肤品或接触动物皮毛等原因引起的，会导致脸上长针尖大小的密集丘疹，引起瘙痒或者疼痛，可以遵医嘱使用复方醋酸地塞米松乳膏、氢化可的松乳膏等药物进行治疗，能够促进恢复。
5、皮癣：一般是真菌感染所致，会导致脸上长红色痘痘或斑块，还会引起脱皮、瘙痒等症状，可以在医生的指导下使用伊曲康唑胶囊、盐酸特比萘芬片等药物进行治疗，具有抗真菌的作用。
13岁男孩正处于青春发育期，体内激素分泌可能处于紊乱状态，导致脸上长痘痘，在日常生活中应保持皮肤清洁，定期洗脸，避免油脂和污垢堵塞毛孔。